Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF3RQ99062 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms