Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CRBNQ96SW2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRBNQ96SW2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRBNQ96SW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms