Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAPLN3Q96S86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms