Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLCC1Q96S66 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLCC1Q96S66 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms