Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS6KC1Q96S38 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KC1Q96S38 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms