Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS4Q96RK4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS4Q96RK4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS4Q96RK4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms