Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IPQ96QF0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms