Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP5Q96PP8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP5Q96PP8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP5Q96PP8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms