Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms