Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC7Q96M83 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC7Q96M83 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms