Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C9orf72Q96LT7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9orf72Q96LT7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms