Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX27Q96L92 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX27Q96L92 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX27Q96L92 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms