Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABS1Q96KC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms