Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS50Q96JG6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms