Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSL1Q96IY1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSL1Q96IY1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms