Protein–RNA interactions for Protein: Q96H72

SLC39A13, Zinc transporter ZIP13, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A13Q96H72 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A13Q96H72 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A13Q96H72 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A13Q96H72 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms