Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNFT2Q96EX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNFT2Q96EX2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms