Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL53Q96EL3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms