Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C18orf8Q96DM3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf8Q96DM3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf8Q96DM3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms