Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPS1Q96D71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms