Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCCAG3Q96C92 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCCAG3Q96C92 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms