Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms