Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME1Q96AY2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EME1Q96AY2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms