Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTPBP3Q969Y2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTPBP3Q969Y2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP3Q969Y2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms