Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFKQ969G6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFKQ969G6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms