Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
P3H4Q92791 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3H4Q92791 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3H4Q92791 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P3H4Q92791 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms