Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL2Q92772 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms