Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN4Q92575 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms