Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC1Q92574 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.4 ms