Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4AQ8WYN0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4AQ8WYN0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG4AQ8WYN0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms