Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSPC1Q8WXF1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSPC1Q8WXF1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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