Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PYDC1Q8WXC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC1Q8WXC3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms