Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC12Q8WUD4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC12Q8WUD4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms