Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD1Q8NHV4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD1Q8NHV4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD1Q8NHV4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD1Q8NHV4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms