Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTLL11Q8NHH1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTLL11Q8NHH1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTLL11Q8NHH1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTLL11Q8NHH1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTLL11Q8NHH1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms