Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM58Q8NG06 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms