Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADM4Q8NFZ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADM4Q8NFZ8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms