Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACBD4Q8NC06 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACBD4Q8NC06 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACBD4Q8NC06 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACBD4Q8NC06 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACBD4Q8NC06 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACBD4Q8NC06 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACBD4Q8NC06 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACBD4Q8NC06 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms