Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD2AQ8NA29 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms