Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC89Q8N998 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC89Q8N998 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms