Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC33Q8N5R6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC33Q8N5R6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.2 ms