Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPM1KQ8N3J5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1KQ8N3J5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms