Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
VWDEQ8N2E2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
VWDEQ8N2E2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
VWDEQ8N2E2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
VWDEQ8N2E2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
VWDEQ8N2E2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
VWDEQ8N2E2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms