Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00518Q8N0U6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms