Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC116Q8IYX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC116Q8IYX3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms