Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms