Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK2Q8IWQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK2Q8IWQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms