Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS6Q8IU80 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms