Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMC4Q7Z404 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMC4Q7Z404 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms