Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX7Q7RTT5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX7Q7RTT5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms