Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 PAM16-203ENST00000571819 317 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.683e-11■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.623e-11■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 P3H4-205ENST00000484247 1866 ntTSL 214.72□□□□□ -0.053e-11■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 FBXL13-203ENST00000379308 2577 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 FBXL13-202ENST00000379305 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 FBXL13-206ENST00000448002 2582 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.911e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 28.4
LARP4Q71RC2 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 224.5■■□□□ 1.514e-8■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 319.02■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 TRAPPC1-203ENST00000571739 648 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 TRAPPC1-202ENST00000540486 759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 PDLIM2-214ENST00000452226 845 ntTSL 216.71■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 PDLIM2-215ENST00000456545 757 ntTSL 516.58■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 PDLIM2-208ENST00000416159 880 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 TMEM222-208ENST00000486082 994 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 S100A4-205ENST00000468373 537 ntTSL 214.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 CMTR1-203ENST00000457419 769 ntTSL 313.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 S100A4-206ENST00000481009 755 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 S100A4-202ENST00000368714 531 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 S100A4-204ENST00000368716 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 S100A4-203ENST00000368715 573 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 TMEM222-209ENST00000498220 679 ntTSL 38.39□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 SART3-204ENST00000546728 3637 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 28.3
LARP4Q71RC2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 RBM8A-208ENST00000634130 565 ntTSL 210.06□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 RBM8A-205ENST00000632040 495 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 RBM8A-207ENST00000633781 440 ntTSL 26.02□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 TRAPPC1-207ENST00000575639 561 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 DTL-203ENST00000475419 3662 ntTSL 24.92□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.422e-15■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-15■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 GNG5-203ENST00000487806 557 ntTSL 36.88□□□□□ -1.312e-15■■■■■ 28.2
LARP4Q71RC2 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 222.73■■□□□ 1.235e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-C17orf49-204ENST00000607564 892 ntTSL 520.63■□□□□ 0.895e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.255e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.255e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-206ENST00000552321 739 ntTSL 216.3■□□□□ 0.25e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.035e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.355e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.365e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.877e-11■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.77e-11■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.637e-11■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.237e-11■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.197e-11■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.197e-11■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 UBE2C-205ENST00000372568 914 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.057e-11■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 219.2■□□□□ 0.665e-10■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 518.51■□□□□ 0.555e-10■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.495e-10■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-10■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.015e-10■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 JAK2-204ENST00000636127 2615 ntTSL 514.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 212.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 310.84□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-206ENST00000473478 484 ntTSL 410.11□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 29.94□□□□□ -0.825e-10■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-205ENST00000470063 324 ntTSL 38.81□□□□□ -14e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-225ENST00000637445 958 ntTSL 58.81□□□□□ -14e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.295e-10■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-210ENST00000496158 544 ntTSL 56.77□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-232ENST00000638090 2039 ntTSL 56.65□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-208ENST00000478804 592 ntTSL 55.96□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-216ENST00000635796 1371 ntTSL 55.92□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-218ENST00000636620 475 ntTSL 55.13□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-209ENST00000488372 548 ntTSL 44.25□□□□□ -1.734e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.784e-6■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.737e-12■■■■■ 28.1
LARP4Q71RC2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.687e-12■■■■■ 28.1
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 496.6 ms